Сетчатка данио рерио. Credit: MPI of Neurobiology / Koelsch
Ученые очень любят атласы и каталоги. В новой статье, опубликованной в топовом журнале Neuron, исследователи представили атлас транскриптомов (полный набор синтезируемых клеткой транскриптов — молекул РНК, что равно экспрессии генов клетки) более тридцати типов ганглионарных клеток сетчатки любимой модельной рыбки нейробиологов, данио рерио. Молекулярные профили этих типов клеток коррелируют с их морфологическими и физиологическими особенностями.
«Используя одноклеточную транскриптомику, мы систематически классифицировали ганглионарных клеток сетчатки у взрослых рыбок и их мальков, тем самым идентифицируя маркерные гены для >30 зрелых типов и нескольких промежуточных звеньев развития. Мы использовали этот набор данных для разработки трансгенных линий драйверов, обеспечивая конкретный экспериментальный доступ к подмножеству типов этих клеток», — пишут авторы работы.
Графический абстракт работы
Molecular classification of zebrafish retinal ganglion cells links genes to cell types to behavior
Yvonne Kölsch, Joshua Hahn, Anna Sappington, Karthik Shekhar, Joshua R. Sanes, Herwig Baier
Neuron, DOI: 10.1016/j.neuron.2020.12.003