Ученые из Университета Айовы искали признаки старения в транскриптоме человека и плодовой мушки Drosophila melanogaster. Для этого они сравнивали последовательности РНК из префронтальной коры людей и мозга мух разного возраста. Согласно результатам исследования, по экспрессии 50 консервативных (то есть эволюционно старых) генов можно определить возрастную группу как мухи, так и человека — со средней точностью 93% и 80% соответственно. Исследование опубликовано в PLoS One.
С возрастом растет риск нейродегенеративных заболеваний. Старение влияет на префронтальную кору, которая отвечает за принятие решений, память и обучение. При этом в коре со временем изменяется экспрессия некоторых генов. Но раньше было неизвестно, насколько эти изменения значимые и присутствуют ли они у других видов.
Почему ученых интересуют общие гены старения мухи и человека? Если исследовать признаки старения у разных видов, можно найти эволюционно древние, консервативные гены, отвечающие за этот процесс. Это поможет подобраться к самым базовым механизмам старения и даст ключ к его предотвращению. Кроме того, животные с теми же генами старения, что у человека могут стать модельными организмами.
В данной работе ученые использовали открытые данные по экспрессии генов в префронтальной коре человека и в мозге мух из трех возрастных групп (молодые, старые, среднего возраста). Всего анализировали 9650 генов мух и 16879 генов человека. Среди них нашли 50 генов, которые коррелируют с возрастом у обоих видов. Из них:
Кроме того, с помощью машинного обучения исследователи смогли предсказывать возрастную группу особи по ее транскриптому со средней точностью 93% для мух и 80% для человека.
Автор: Анастасия Новицкая
Webb JL, Moe SM, Bolstad AK, McNeill EM (2021) Identification of conserved transcriptome features between humans and Drosophila in the aging brain utilizing
Читайте материалы нашего сайта в Facebook, ВКонтакте, Яндекс-Дзен, Одноклассниках и канале в Telegram, а также следите за новыми картинками дня в Instagram
